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TauContrast 对图像复杂样本的好处

STELLARIS 故事:Timo Zimmermann博士的访谈

[Translate to chinese:] Root-hypocotyl junction of Arabidopsis thaliana. Image acquired with TauContrast. Sample courtesy: Dr. Melanie Krebs, COS, University of Heidelberg. Stellaris-Arabidopsis-thali.jpg

在这次访谈中,Timo Zimmermann博士谈到了他在应用TauSense工具方面的经验,以及这些工具在研究厚样本或超大胚胎等复杂样本中的潜力。作为巴塞罗那基因组调控中心(CRG)先进光学显微镜单位的负责人,Timo Zimmermann博士在2020年测试了STELLARIS 5共聚焦系统。

您使用 STELLARIS 5 的体验如何?

Timo Zimmermann博士: 我使用STELLARIS 5系统的体验非常积极。开始使用该系统非常简单,我能够轻松应用我对共聚焦成像的现有知识来设置实验。我特别高兴看到共聚焦成像现在可以扩展到包括基于寿命的信息。我喜欢STELLARIS如何通过不同的TauSense工具使基于寿命的信息变得易于获取,这在以前是相当复杂的。现在,只需点击一个按钮,荧光寿命测量就可以作为您共聚焦实验的另一个附加功能,拥有这种额外对比的可能性对我来说非常有趣。

此外,STELLARIS由于其新型探测器的应用显得非常高效,这些探测器可以在模拟和光子计数模式下工作:使用极少的功率,您就可以获得出色的信号结果。

请告诉我们更多关于您使用 TauSense 的体验。

Timo Zimmermann博士: 我经常使用TauContrast功能,它将每个像素的平均寿命信息作为单独的图像通道添加。因为您可以使用脉冲照明作为大多数光谱的标准激发,所以实际上可以免费从探测器中获得寿命信息。这非常重要,因为它以一种极其简单的方式为每个荧光信号提供了另一个维度,实际上是荧光团的一个定义特征。

我主要在一个相当复杂的生物样本中使用TauContrast。在这种情况下,寿命信息除了不太具体的光谱信息外,还增加了很多额外的信息,因此您可以更好地区分结构。换句话说,它在理解复杂形态方面显著帮助了我。我相信,对于那些有大量自然信息的视觉和结构上复杂的样本,不仅仅是您添加的荧光团,它是非常有用的,因为您可以同时看到这些自然结构和标记的结构。

使用 TauContrast 是否让您获得了更多信息,还是让您能够区分已有的信息?

Timo Zimmermann博士: 它让我获得了更多的信息。如果样本中唯一的荧光信号是您通过已建立的荧光标签引入的,并且这些信号在光谱中分布良好,那么寿命信息可能并不是必须的。但是,当您面对更复杂的信息,比如带有背景的样本或结构复杂的样本时,使用寿命信息可以帮助分离不同的信息片段,从而使您更容易理解那些在发射光谱中看起来相似的不同结构。荧光团的特征在于其激发光谱、发射光谱和寿命。获得这三者的信息可以帮助您全面了解样本。考虑到荧光光谱中可能存在的显著重叠,这确实非常有帮助。

研究人员可以利用的其他寿命信息的用途是什么?

Timo Zimmermann博士: 使用TauGating在较厚样本中去除背景非常有用。这是一个可以将信号分隔到不同区域的功能,并通过这些分隔去除背景。对于要求较高的样本,例如厚样本或超大胚胎,获取寿命信息具有很大的潜力,因为这将使您能够专注于重要内容,并帮助您更好地理解这些复杂样本。像类器官和模式生物这样的样本,正在变得越来越重要,因为它们更好地模拟了真实生物学。通过像TauSense这样的新技术,您可以更好地观察这些样本。

拥有荧光寿命信息可以帮助您更好地理解复杂样品。

Timo Zimmermann博士

除了寿命信息的获取,您认为STELLARIS还能为平台用户提供哪些其他好处?

Timo Zimmermann博士: 这是一个非常完整的系统,因为它还具有其前代产品的独特功能,如共振扫描仪、AOTF(声光可调滤波器)和AOBS(声光分束器),这些功能可以去除所有玻璃滤光片和分束器组件,或利用白光激光实现光谱自由。对于共聚焦实验来说,这些功能仍然非常关键,而STELLARIS在这些功能的基础上进行了改进并增加了新的功能。

如果您正在运营一个核心设施,系统的灵活性是至关重要的,而STELLARIS在设计上很好地反映了这一点。STELLARIS可以满足我们在核心成像设施中对共聚焦显微镜的所有需求,尤其是在检测方面没有限制,您可以自由使用白光激光,并根据需要进一步调整激发光源。如果需要更大的功率,还可以添加固态激光器。而且,正如之前提到的,白光激光是脉冲的,因此您几乎可以免费使用寿命信息,这是一大优势。

所以,这只是一个非常灵活的系统。它从各个角度为共聚焦实验提供了自由:共振扫描仪在需要时提供速度,因为它可以在成像过程中随时切换,还有非常好的通用Power HyD探测器,可以在模拟和光子计数模式之间切换。拥有这两种模式为您提供了许多可能性,您可以轻松地在模式之间切换,并且还可以为每个探测器单独设置它们,从而在动态范围上有更多选择。软件界面ImageCompass的新设计在荧光通道选择方面提供了良好的可访问性。因此,对我来说,STELLARIS在共聚焦成像方面具有全面的适用性。

该采访是在 2021 年 2 月Timo Zimmermann回到海德堡的欧洲分子生物学实验室(EMBL)后进行的。

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