Dorothy Crowfoot Hodgkin Building, Department of Biochemistry, University of Oxford

牛津大学微米生物成像设备

了解如何使用牛津大学生物化学系的尖端显微镜系统,并获得专门的培训和支持。

Micron生物成像设备卓越中心

卓越中心成立于 2023 年,欢迎来自世界各地的研究人员使用徕卡显微系统公司最先进的光学显微镜系统进行常规和高级(亚)细胞成像。位于生物化学系内的 Micron 生物成像设施的工作人员为学生和专业人员提供世界一流的教育和培训,帮助科学家们拓展对细胞和组织内部运作的理解。

卓越中心将徕卡显微系统公司的显微镜专业技术与牛津大学的卓越学术成就相结合,其使命是推动科学研究,并在光学和超分辨率显微镜、人工智能(AI)、相关显微镜和电子显微镜(EM)标本制备等方面倡导最先进的技术。

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请访问 Micron 生物成像设备网站,了解您如何获得先进的成像技术,以及专家对您项目的指导和支持。

最新更新

超分辨率显微镜系统是英国癌症研究中心 "美学 "活动认可的突破性研究的核心部分

通过共享知识增强科学界的能力

该中心营造了一种协作式培训文化,以促进学习和培养未来人才。来自科学界的专家们可以通过讲习班和研讨会相聚一堂,交流见解,拓展专业知识。

在该设施内,研究人员可以使用最新的高端共聚焦和宽场显微镜系统,并受益于徕卡应用专家提供的身临其境的培训课程。科学家可以利用具有 TauSTED Xtend 功能的最新一代 STELLARIS 共聚焦显微镜系统,利用超分辨率活细胞成像等显微镜工作流程和技术。该设施还有一个THUNDER Image Cell设备,被研究人员大量用于各种宽场成像应用。他们还可以与邻近的 COSMIC CryoEM 设备合作,利用低温荧光成像技术与低温电子显微镜(cryoCLEM)进行关联。

此外,该机构还提供配备 Aivia AI 图像分析软件的专用分析套件。

Micron成像中心的成像技术

从细胞动力学到复杂组织分析,Micron 支持的研究人员正在使用徕卡显微系统研究生物过程,并解决生命科学研究中的关键科学问题。

研究胰腺导管腺癌

生物化学系的 Zeinab Rekad 博士对在模拟胰腺导管腺癌早期阶段的条件下 RNA 转录和成熟是否全面失调感兴趣。永生化小鼠胰腺细胞暴露于尿苷类似物中,尿苷类似物会与新转录的 RNA 结合。随后是点击化学。为了检测和计算每个细胞的核小体和 RNA 剪接调控单元(斑点单元)的数量,Rekad博士使用了 Micron 生物成像设备中的THUNDER Image Cell。通过应用THUNDER小体积计算解析(SVCC)方法,她能够消除失焦模糊,生成高分辨率、高对比度的图像。核小体的信号强度用于评估 rRNA 的表达水平。最后,使用掩膜和形状描述符分析评估了结构的形状。

了解神经和血管系统的分子机制

生物化学系的 Elena Seiradake 教授对引导细胞形成神经和血管网络等复杂组织的机制很感兴趣。她的研究小组一直在Micron成像中心使用 STELLARIS 系统,取得了一些令人振奋的成果。

Human iPSC-derived mid brain organoid. Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.
Human iPSC derived mid brain organoid. Stained with MAP2 (green), DAPI (blue) and TH (red). Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk; scale bar 200 µm. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.
Immortalised mouse pancreatic epithelial cells labelled with DAPI (blue), JF azide dye (shown in green), Alexa 647 (pink) and A555 (yellow) to stain various RNA bio-genesis sub nuclear compartments, here mainly nucleoli (rRNA synthesis) and nuclear speckles (RNA splicing regulatory units). Image acquired using a 100x oil immersion objective on the THUNDER Imager Cell, without (left) and with (right) THUNDER computational clearing applied. Courtesy of Dr. Zeinab Rekad, Department of Biochemistry, University of Oxford.
Human colorectal carcinoma cells. Maximum intensity projections of 8 prometaphase-metaphase mitotic spindles in HCT116 human colorectal carcinoma cells, captured using STELLARIS TauSTED microscopy. The kinetochore protein NDC80 is shown in red, alpha-Tubulin in green, and DNA in blue. Courtesy of  Danny Gold (Francis Barr lab), University of Oxford.
3D human bladder microtissue infected with E.coli. Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk. Courtesy of Dr Ramon Garcia Maset, University of Oxford and University College London (UCL).
Human iPSC-derived mid brain organoid. Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.
Human iPSC derived mid brain organoid. Stained with MAP2 (green) and DAPI (blue). Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk; scale bar 50 µm. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.
Human iPSC derived mid brain organoid. Stained with MAP2 (green), DAPI (blue) and TH (red). Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk; scale bar 200 µm. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.
Immortalised mouse pancreatic epithelial cells labelled with DAPI (shown in blue), JF azide dye (shown in green), Alexa 647 (shown in pink) and A555 (shown in yellow) to stain various RNA bio-genesis sub nuclear compartments, here mainly nucleoli (rRNA synthesis) and nuclear speckles (RNA splicing regulatory units). Image acquired using a 100x oil immersion objective on the THUNDER Imager Cell, without (left) and with (right) THUNDER computational clearing applied. Courtesy of Dr. Zeinab Rekad, Department of Biochemistry, University of Oxford.
Human colorectal carcinoma cells. Maximum intensity projections of 8 prometaphase-metaphase mitotic spindles in HCT116 human colorectal carcinoma cells, captured using STELLARIS TauSTED microscopy. The kinetochore protein NDC80 is shown in red, alpha-Tubulin in green, and DNA in blue. Courtesy of  Danny Gold (Francis Barr lab), University of Oxford.
3D human bladder microtissue infected with E.coli. Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk. Courtesy of Dr Ramon Garcia Maset, University of Oxford and University College London (UCL).
Human iPSC-derived mid brain organoid. Image acquired using THUNDER Imager Cell Spinning Disk. Courtesy of Dr Tanya Singh (Salman and Wade-Martins Lab), Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford.

将徕卡 STELLARIS 纳入我们的研究极大地提高了我们直接观察指导细胞行为的独特分子组合的能力。STED 显微镜提供的纳米级分辨率为我们了解神经和血管系统中受体控制生物过程的基本机制提供了新的视角。

Prof. Elena Seiradake

Elena Seiradake 教授代表牛津大学生物化学系 Seiradake 实验室。

这种合作关系使用户可以直接使用徕卡显微系统的尖端显微技术和全球专业知识。我们共同建立了一个环境,让研究人员可以定制他们的成像工作流程,并与 Leica 和 Micron 密切合作,推进他们的科学目标。

Dr. Deirdre Kavanagh, Micron Bioimaging Facility

Deirdre Kavanagh 博士,Micron 生物成像设施经理。

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Learn multiscale organoid imaging: fixed high content phenotyping, gentle dual view light sheet, and reproducible pipelines that turn 3D data into insights.
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癌症研究中显微镜的历史、发展和趋势

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Virally labeled neurons (red) and astrocytes (green) in a cortical spheroid derived from human induced pluripotent stem cells. THUNDER Model Organism Imager with a 2x, 0.15 NA objective at 3.4x zoom was used to produce this 425 µm Z-stack (26 positions) which is presented here as an Extended Depth of Field (EDoF) projection. Images courtesy of Dr. F. Birey, Dr. S. Pasca laboratory, Palo Alto, CA.

活细胞成像指南

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Developing embryos of different species at different stages during the elongation of their posterior body axis, from left to right in developmental time. The labelled regions in red depict a region of undifferentiated cells called the tailbud, with the corresponding region generated from that tissue shaded in grey. Upper row: lamprey; middle row: catshark; bottom row, zebrafish. This figure has been adapted from the following publication: Steventon, B., Duarte, F., Lagadec, R., Mazan, S., Nicolas, J.-F., & Hirsinger, E. (2016). Species tailoured contribution of volumetric growth and tissue convergence to posterior body elongation in vertebrates. Development, 2016. 143(10):1732-41

如何研究胚胎发育过程中的基因调控网络

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认识Micron生物成像中心的团队

Lothar Schermelleh,生物成像教授& 学术主任

Lothar 于 2011 年加入生物化学系,担任 Micron 高级研究员和首席研究员,领导开发了用于标准化质量控制的计算分析工具,并改进了超分辨率三维结构照明显微镜(3D-SIM)的荧光标记协议。他的生物学研究旨在利用先进的光学成像技术,了解哺乳动物细胞中三维核组织、染色质结构和基因组功能之间的关系。该实验室目前的研究重点是揭示生物物理作用力、表观遗传记忆和凝聚素复合体活性之间的调控作用和相互作用,以调节细胞类型特异性转录程序。2020 年 11 月,他成为Micron成像中心的学术总监。同年,他被任命为副教授,并于 2024 年成为教授。

Deirdre Kavanagh 博士,Micron 生物成像设施经理

2021 年 5 月,Deirdre 加入生物化学系,担任 Micron 设施经理。她是一名跨学科科学家,专门研究超分辨率显微镜、荧光相关光谱学和光片技术,拥有工程和物理科学博士学位。Deirdre 主要负责监督Micron成像中心的日常运营。在博士后研究期间,她应用先进的超分辨率显微镜来研究支配细胞通讯的蛋白质相互作用、组织和动态。除管理该设施外,她还积极参与组织和开发显微镜讲习班、培训课程和公众参与活动。她是多个显微镜委员会的成员,包括皇家显微镜学会光学显微镜委员会。

Niloufer Irani 博士,Micron生物成像设施副经理

Niloufer 于 2021 年加入 Micron,之前在牛津大学植物科学系工作,研究方向为内膜组织的分子机械学、运输及其与信号的联系。她利用在Micron成像中心价值数百万英镑的研究设备的机会,为全世界都在考虑的实验问题带来了突破性思维。作为一名独立科学家,她曾在印度、美国、比利时和英国学习和工作。Niloufer 全面参与设施管理、教学、培训、咨询、样品制备和仪器维护。她与徕卡应用专家一起积极组织徕卡研讨会,与所有用户分享显微镜最佳实践。

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