深入了解肿瘤微环境
理解癌症发生和进展的本质需要了解肿瘤微环境(TME)的细节。然而,由于 TME 的复杂性,包括多种组织、细胞类型和动态变化,许多传统的细胞生物学工具无法全面捕捉这一领域的完整图谱。空间生物学方法对于理解这些细胞、组织和分子成分之间复杂的空间关系至关重要,这反过来又为疾病进展、治疗反应和靶向治疗干预的发展提供了宝贵的见解。通过研究多个生物标志物通道并使用多重空间成像在单个样本中可视化它们,我们可以全面了解生物系统中不同生物标志物之间的复杂相互作用。传统的宽场显微镜在同时成像的生物标志物数量上可能受到限制。由于光谱重叠和可用荧光染料组合的限制,在同一样本中可视化和区分大量生物标志物(即超过 6-7 个)变得具有挑战性。 这在研究涉及众多生物标志物和复杂分子相互作用的高度复杂生物系统时构成了重大限制。
Cell DIVE-IBEX 混合方法:推动研究中的多重成像
Cell DIVE就是一种帮助用户进行此类成像的端到端解决方案。Cell DIVE 使用一种专利的温和组织保护染料灭活溶液,允许对样本中的 60 多种生物标志物进行迭代染色。然而,还有其他化学方法和技术可以实现类似的成像技术。在科学文献中,一种流行的方法被称为 IBEX(迭代漂白扩展多重性)成像。它是由马里兰州贝塞斯达的国家卫生研究院Ronald Germain 实验室发明的。IBEX 被设计为一种非商业解决方案,用于迭代多重化,并提供了广泛兼容的抗体(250 多种)、染料(16 种以上)以及简化图像采集的软件包。然而,IBEX 用户可能会对利用 Cell DIVE 所提供的工作流程简化、过程自动化、软件和图像处理工具感兴趣。
在Andrea Radtke和德国实验室其他研究人员最近发表的一项研究中,提出了一种名为 Cell DIVE-IBEX 的新型混合方法,证明了这一概念是可以轻松实现的。总体而言,针对 IBEX 开发的抗原回收、抗体染色和染料灭活方法被用于处理样本,以便利用 Cell DIVE 成像仪和软件进行成像。这使得研究的部分规模增加了超过 4 倍,从而更深入地探讨了患者样本中滤泡淋巴瘤进展相关的问题。