Multiplexed Imaging Reveals Tumor Immune Landscape in Colon Cancer
Cancer immunotherapy benefits few due to resistance and relapse, and combinatorial therapeutic strategies that target multiple steps of the cancer-immunity cycle may improve outcomes. This study shows…
AI-Powered Hi-Plex Spatial Analysis Tools for Breast Cancer Research
Breast cancer (BC) is the leading cause of cancer-related deaths in women. Investigating the tumor microenvironment (TME) is crucial to elucidate the mechanisms of tumor progression. Systematic…
Improving Zebrafish-Embryo Screening with Fast, High-Contrast Imaging
Discover from this article how screening of transgenic zebrafish embryos is boosted with high-speed, high-contrast imaging using the DM6 B microscope, ensuring accurate targeting for developmental…
利用人工智能驱动的空间蛋白质组学绘制肿瘤免疫图谱
未经治疗肿瘤的空间图谱分析可呈现肿瘤免疫结构的整体特征，有助于理解治疗反应。具有免疫活性的小鼠模型对于识别肿瘤发生发展过程中免疫依赖性事件至关重要。要表征这些具有完整免疫系统及相互作用细胞组分的模型，需要采用多重标记分析技术。我们展示了一种基于人工智能的空间蛋白质组学方法，用于研究小鼠癌组织中的肿瘤-免疫互作机制。
深度视觉蛋白质组学提供精确的空间蛋白质组信息
尽管可使用基于成像和质谱的方法进行空间蛋白质组学研究，但是图像与单细胞分辨率蛋白丰度测量值的关联仍然是个巨大的挑战。最近引入的一种方法，深层视觉蛋白质组学（DVP），将细胞表型的人工智能图像分析与自动化的单细胞或单核激光显微切割及超高灵敏度的质谱分析结合在了一起。DVP在保留空间背景的同时，将蛋白丰度与复杂的细胞或亚细胞表型关联在一起。
阿尔茨海默病神经免疫相互作用的空间分析
阿尔茨海默病（AD）是一种复杂的神经退行性疾病，以神经原纤维缠结、β-淀粉样斑块和神经炎症为特征。这些功能障碍由局部免疫反应触发或加剧。因此，在空间背景下理解神经免疫相互作用对于阐明 AD 发病机制至关重要。本研究采用 Cell DIVE 多重成像技术和 Aivia 人工智能辅助空间分析工具，探究 AD 病理标志物周围免疫细胞的特征。
双视野光片显微镜，适用于大型多细胞系统
展示复杂多细胞系统的动态是生物学中的一个基本目标。为了应对在大型时空尺度上进行活体成像的挑战，作者在《自然·方法》杂志上发表的一篇论文中介绍了一种开放式多样本双视野光片显微镜。研究发现，Viventis LS2 Live显微镜在以单细胞分辨率成像大型样本方面取得了显著进展。
肿瘤空间微环境的元癌症分析
研究 TME中肿瘤、基质和免疫细胞之间的相互作用需要采用超多重免疫荧光成像方法。在这里，我们分析了一组Cell Signaling Technology（CST®）抗体，这些抗体针对肺癌、结肠癌和胰腺癌等癌症的标志物。通过Cell DIVE成像和Aivia中的聚类分析，我们确定了TME中的空间相互作用，包括组织特异性和共有的相互作用。
通过成像和AI绘制结直肠癌的景观
结肠癌是一种高负担疾病。尽管进行了化疗干预和手术切除，但疾病可能会复发。了解结肠癌微环境对于改善治疗效果是必要的。在这里，我们使用空间生物学方法，通过Cell DIVE和 Aivia可视化结肠腺癌组织中的30个生物标志物。我们探讨了肿瘤组织的血管化、免疫细胞反应和细胞增殖。
