压力循环技术(PCT, PressureBioSciences Inc.)利用高压为大规模分析加快样本制备。PCT可在1小时内完成对LMD样本的处理,更大的活检组织块则可在3小时内完成处理。
此联用技术可以高精度、快速地分离肿瘤微环境。来自不同组织区域的下游分子分析将带来重大意义,因为下游分子可以进行单独分析,而不用再作为混合物加以分析。
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单细胞精度下的生物标记物探索工作流程
徕卡激光显微切割系统能够精准切割您感兴趣的单个细胞,改进您的工作流程。所以工作都在可视化控制之下,绝对不会污染到周围组织。
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1.样品制备
通常,激光显微切割使用特殊的基于膜的载玻片。激光显微切割的样品制备简单明了,可以从传统的组织学制备中得到。
对于下游蛋白质组学,我们推荐使用几乎不含增塑剂的 PET 膜载玻片,或者使用完全无膜烧蚀的 DIRECTOR™ 载玻片。
石蜡包埋将组织样本制成可切成薄片的构造。或者您可以利用冷冻切片法来准备载玻片。
我们将为您的应用程序提供适当的 LMD 演示说明。
2. 固定和染色
LMD应用中可根据感兴趣的结构来对组织进行固定和染色。此处包括了明场和荧光染色。
该步骤可通过染色设备实现自动化处理。
绝大多数染色剂一般都与下游蛋白组学相容。尽管如此,我们依然有必要做提前的调查。
3.可视化和 ROI
徕卡 LMD 激光显微切割系统可以生成自动样本概览,可用于轻松导航到您感兴趣的区域(ROI)。
您的 ROIs 可以由 ADM 软件模块自动识别和标记,或者您可以手动应用形状。
- 有关Leica LMD 激光显微切割系统的更多信息
- 激光微解剖文章和教程
Mouse brain, Cresyl violet. Before and after auto detection (ADM) of neurons.
4. 激光显微解剖
接下来在目测控制下通过激光切出指定的ROI并直接通过重力作用进行收集。
点击鼠标即可分离出癌症材料或任何其他ROI并进行必要的汇集,然后按需要收集到1个或多个不同的反应容器内。
您可以使用标准耗材如PCR试管,或者利用指定的LMD收集装置将样本直接收集到下游分析容器内如PCT μTubes试管(Pressure BioSciences Inc.),详见下一步操作。
References
- Lee S et al., Cell Reports 2020, https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.03.066
- Hunt AL et al., Cancer Res 2019;79 doi.org/10.1158/1538-7445.AM2019-4709
- Guo T et al., Nat Med. 2015; 21:407-13
- Shao S et al., Proteomics 2015; 15: 1-11
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